Dans un monde où les mémoires des défunts deviennent des livres, les "archivistes armés" maintiennent l'ordre en protégeant ces derniers et affrontent depuis toujours le "culte des noyés de Dieu", une mystérieuse organisation qui prône le bonheur par l'accomplissement des désirs personnels. Hamyuts, directrice adjointe de la Bibliothèque, envoie le groupe d'archivistes de Volken attaquer le quartier général du culte, un navire appelé "La fumée d'argent", afin de délivrer les prisonniers à son bord. Mais les archivistes découvrent sur le bateau que les prisonniers ont été embrigadés pour devenir des bombes humaines...

Colio Tonies, la bombe humaine amnésique qui a pour mission de tuer Hamyuts Meseta, arrive aux mines de Toatt, la ville où sont déterrés les livres. Alors que ses camarades meurent un à un dans des explosions, Colio reçoit d'un homme mystérieux un fragment de livre de la mémoire de Shiron, la mystérieuse princesse aux cheveux aux trois couleurs. Il ignore qu'elle était surnommée autrefois la sorcière souriante...

Un nouveau fragment du livre de la sorcière souriante tombe entre les mains de Colio Tonies. Bouleversé par le passé tragique de la jeune femme il ne remarque pas l'arrivée de Hamyuts Meseta. Amusée de voir le jeune homme éprouver à nouveau des sentiments, elle décide de le laisser en vie, non sans l'avoir auparavant débarrassé de ses explosifs. La jeune femme a par ailleurs d'autres préoccupations : un membre du Culte des noyés de Dieu se trouve toujours dans la ville et a décidé de l'affronter…

Le piège de Cigal se referme sur Hamyuts Meseta et les pouvoirs de la jeune femme s'atténuent alors que celle-ci succombe peu à peu à la pneumonie du Dragon. Usant de son épée maudite, Shlamuffen, Cigal attaque sans relâche Hamyuts qui se retrouve vite acculée. Alors que Cigal est sur le point de remporter l'affrontement, Colio se dresse devant lui...

Depuis la bataille de la Fumée d'Argent, Volken, le jeune archiviste armé, était en conflit avec Hamyuts Meseta. Dérobant Ückück, l'une des sept armes de guerre de la mémoire, il disparait de la bibliothèque de Bantorra, se rendant coupable de trahison. Sa camarade de longue date Mirepoc réagit mal à ces actions et ne peut cacher son trouble...

Un étrange homme masqué qui se surnomme lui même "le monstre" attaque la Bibliothèque de Bantorra. Les archivistes présents découvrent avec stupéfaction que ce nouvel adversaire maîtrise plusieurs formes de magie et ont bien du mal à lui faire face. Durant ce temps, Noloty poursuit son enquête à Bujuia afin de retrouver le livre disparu de Ruimon. Elle est rejointe par Hamyuts Meseta qui souhaite lui confier une autre mission...

Noloty décide de suivre Zatoh Rondohon à Bujuia conformément aux instructions d'Hayuts Meseta. L'homme semble se remémorer des événements passés liés au culte des Noyés de Dieu. Pendant ce temps, Minth, un autre archiviste, arrive aussi à Bujuia avec pour mission de traquer le monstre qui a attaqué Bantorra...

Noloty et Minth traquent ensemble Zatoh, l'étrange homme qui voulait mourir et qui se révèle être le fameux "monstre" qui a attaqué la Bibliothèque de Bantorra. Ce dernier leur révèle qu'il a le pouvoir d'absorber les livres des morts ainsi que les pouvoirs de ses propriétaires...

Arrivé avec Noloty à Bantorra, Enlike est accueilli par le regard hostile des autres archivistes. Noloty tente d'empêcher son camarade Ruweek de venger sa camarade tuée par le "monstre" mais Enlike accepte le combat sans broncher. A ce moment, le Vrai Homme Ganbanzel reprend contacte avec Enlike, bien décidé à reprendre le contrôle et lui faire éradiquer l'humanité...

Mokkania est un archiviste armé dont la puissance égale celle de Hamyuts Meseta. L'homme est cependant instable psychologiquement et reste cloîtré dans le labyrinthe souterrain de Bantorra. Jusqu'au jour où il reçoit une visite inattendue qui va le pousser à se rebeller contre Hamyuts et les autres archivistes...

La rébellion de Mokkania transforme la bibliothèque en un labyrinthe de fourmis sous lesquelles les archivistes tombent les uns après les autres. Mais grâce à la magie d'Ireia, Hamyuts récupère Shlamuffen et contre-attaque. Pendant ce temps Winkeny, l'agent du culte des Noyés de Dieu, continue ses manipulations. Qui est la femme qui prétend être la mère de Mokkania ?

Mattalast est le bras droit et l'ancien amant de Hamyuts Meseta. Alors qu'il prend son petit déjeuner avec elle, il se remémore leur rencontre : lorsqu'il était un jeune archiviste plein de doutes vis-à-vis du monde, Mattalast rencontra dans un bar Hamyuts, une étrange jeune fille aux pouvoirs prodigieux...

Minth, l'archiviste qui a le pouvoir de voir les âmes d'autrui, se rend à Gandari à la recherche du livre rouge. Celui-ci est un livre tabou composé de fantasmes et de souvenirs de criminels psychopathes qui provoquent jouissance et dépendance à ceux qui le lisent. Accompagné de Yuri et de Yukizona, deux archivistes élitistes, il retrouve durant son enquête Greihn, son camarade de sa vie d'antan...

Après avoir disparu en dérobant le Ückück, Volken est de retour à Bantorra. Face aux archivistes se sentant trahis, le renégat annonce qu'il prouvera les méfaits de Hamyuts Meseta pour ramener la justice à la Bibliothèque. Durant ce temps, Renas Fluru, l'imposteur conditionnée pour croire qu'elle était la mère de Mokkania, vit paisiblement à Bantorra. Mais Enlike commence à voir en elle une autre personnalité qui cherche à retrouver ce qu'elle a perdu...

Afin de recouvrer la mémoire de la seconde conscience qui réside en Renas, Volken se rend en compagnie de la jeune femme aux les mines de Darai. Il est arrêté sur sa route par Vizac, son ancien maître. Pendant ce temps, Hamyuts réalise la véritable nature de la conscience résidant en Renas et entame seule la poursuite, se remémorant une ancienne mission secrète...

Olivia Litlet, la véritable personnalité de Renas Fluru, a autrefois lutté pour libérer les chairs du joug du culte des Noyés de Dieu. Afin de retrouver la magie qu'elle a implantée autrefois dans le Ückück, elle fait route avec Volken pour la mine de Darai. Mais tous deux sont traqués par Hamyuts Meseta. Volken décide alors de lutter afin d'anéantir celle qui pour lui corrompt la justice des archivistes armés...

Devenue officiellement une archiviste, Noloty est chargée d'arrêter un attentat bioterroriste planifié par culte des Noyés de Dieu. Elle réussit à les empêcher de répandre la maladie du gouffre bleu et arrête Arkit, l'organisateur de l'attentat, qui se révèle n'être qu'un enfant. Afin de ramener dans le droit chemin ce garçon qui éprouve une haine profonde pour les archivistes, Noloty l'accompagne pour aller voir Kachua, le le chef du culte des Noyés de Dieu...

L'armée de l'alliance a déclaré la guerre à Bantorra et le combat fait rage entre militaires et archivistes. Malgré le renfort apporté par Hamyuts et Ireia, ces derniers tombent peu à peu, submergés par le nombre de leurs adversaires. En possession du livre de Noloty, Enlike commence à comprendre pourquoi tous leur adversaires sont si emplis de haine envers les archivistes...

Alors que Noloty et Arkit gravissent la montagne, Kachua, le chef du culte des Noyés de Dieu apparaît devant eux pour annoncer la capitulation du culte des Noyés de Dieu. Il demande en échange à Noloty de tuer Arkit. Durant ce temps, Hamyuts et les archivistes sont acculés dans la Bibliothèque assiégée par les armées du monde entier. Tandis que les archivistes tombent un à un, Hamyuts organise une dernière attaque...

Le pêcheur de la violette est l'un des membres du culte des Noyés de Dieu qui a tenté de se rebeller contre le paradis. A l'aide du livre d'un certain Makia que lui a rapporté Lascall, Hamyuts apprend où se trouve cet ancien ennemi et quitte Bantorra précipitamment. Accompagné de Minth elle retrouve le fameux pêcheur, une fille du nom de Chacoly avec qui Hamyuts aurait grandi autrefois...

Chacoly, le pêcheur de la violette, possède le pouvoir de la communion d'âmes ce qui lui permet de manipuler les émotions de ses adversaires. Malgré ses attaques, Hamyuts parvient à tenir tête à celle qui fut autrefois son amie. Pendant ce temps, d'étranges événements se produisent à la Bibliothèque de Bantorra alors qu'un être qui réside dans son sous-sol émerge d'un long et profond sommeil...

Il y a environ 2000 ans, l'ère du paradis où dieux et humains coexistaient prit fin. Le dieu du futur Orntorra lâcha sur l'humanité arrogante les fauves du dernier chapitre. Pour les contrer, l'humanité donna en offrande les livres de cent mille guerriers au seul homme pouvant contrer les dieux : Ruruta Coozancoona. Alors que cet homme ne supportait plus le poids de sa mission, il rencontra une jeune fille du nom de Nieniu...

Le monde est tombé dans un profond sommeil depuis que Ruruta a utilisé le pouvoir de la "conclusion implacable et sereine". Seule Hamyuts tient encore et entame son dernier combat dans les entrailles imaginaires de Ruruta. Ce dernier, qui a assimilé de nombreux livres et détient une puissance colossale, assène des attaques sur Hamyuts qui renaît à chaque fois. Devant un Ruruta médusé, cette dernière libère enfin son véritable pouvoir...

Pendant que Nieniu invoque les monstres du dernier chapitre sur Terre, Hamyuts reçoit le soutient de ses défunts camarades. Ruruta, qui a perdu ses pouvoirs, contacte Mirepoc, restée dans le monde extérieur. Soutenue par tous les terriens, elle accepte de l'aider. Réussiront-ils à sauver le monde ?